Table 4 Significantly phosphorylated RTK and kinase sites in chordoma using Proteome Profiler arrays, ranked based on p-value

Phospho-RTK

EPHB2

0.1285

0.0263

4.9

6.6931E-07

2.8111E-05

EGFR

0.6762

0.1694

3.99

3.8547E-05

0.0008

MSPR

0.1241

0.0426

2.91

0.0019

0.0266

PDGFRB

0.0848

0.0334

2.54

0.0057

0.0600

FGFR3

0.1022

0.0484

2.11

0.0177

0.1487

CSF1R

0.0887

0.0445

1.99

0.0236

0.1652

ERBB4

0.0160

0.0289

1.78

0.0379

0.2272

Phosphorylated kinase site

AKT (T308)

0.3117

0.0313

9.95

3.1253E-21

1.5001E-19

RSK 1/2/3 (S380)

0.1747

0.0212

8.25

1.2388E-15

2.9731E-14

TP53 (S46)

0.2394

0.0336

7.14

2.3075E-12

3.6920E-11

MSK 1/2 (S376/S360)

0.1557

0.0256

6.09

1.3564E-09

1.6277E-08

YES (Y426)

0.1639

0.0288

5.69

1.2512E-08

1.2012E-07

TP53 (S15)

0.2533

0.0469

5.41

5.5176E-08

4.4141E-07

p38a (T180/Y182)

0.2858

0.0625

4.57

3.2798E-06

2.2490E-05

p70 S6K (T421/S424)

0.1086

0.0242

4.49

4.6993E-06

2.8196E-05

CREB (S133)

0.3273

0.1018

3.21

0.0007

0.0038

RSK 1/2 (S221)

0.0707

0.0246

2.87

0.0022

0.0104

SRC (Y419)

0.0934

0.0349

2.68

0.0038

0.0158

TP53 (S392)

0.1237

0.0464

2.67

0.004

0.0158

TOR (S2448)

0.2407

0.1258

1.91

0.0284

0.105

JUN (S63)

0.0863

0.0533

1.62

0.053

0.1818

HSP27 (S78/S82)

0.1048

0.0691

1.52

0.0647

0.2016

eNOS (S1177)

0.2002

0.1331

1.50

0.0672

0.2016

STAT1 (Y701)

0.0465

0.0318

1.46

0.0725

0.2048

STAT5b (Y699)

0.0380

0.0286

1.33

0.0921

0.2457

LYN (Y397)

0.0351

0.0283

1.24

0.1079

0.2725

STAT6 (Y641)

0.0309

0.0284

1.09

0.1382

0.3317

STAT5A (Y699)

0.0656

0.0715

0.92

0.1791

0.4093

FYN (Y420)

0.0587

0.0768

0.76

0.2239

0.4884

STAT5A/B (Y699)

0.0168

0.0366

0.46

0.3229

0.6739

ERK1/2 (T202/Y204. T185/Y187)

0.0284

0.0708

0.40

0.3447

0.6894